根據(jù)工作職責，區(qū)水務局設6個內(nèi)設機構，現(xiàn)有9個下屬事業(yè)單位。

（一）黨政辦公室。負責局機關日常運轉工作；負責重要會議協(xié)調和決定事項的督辦，負責重要文件稿草擬審核、公文管理、政務公開、應急值守、網(wǎng)絡信息、新聞宣傳發(fā)布、機要、保密、檔案、接待、信訪、安全、后勤保障和固定資產(chǎn)管理等工作；承擔機關及局屬單位的干部人事、機構編制、勞動工資；指導水利行業(yè)人才隊伍建設；組織實施目標責任考核工作；負責局機關和局屬單位的黨群、黨風廉政建設等工作。

（二）財務審計股。管理局屬系統(tǒng)預、決算；承擔局機關財務核算管理工作；指導局屬單位財務管理工作；負責局屬系統(tǒng)政府采購和國有資產(chǎn)的監(jiān)督管理工作；負責局屬單位內(nèi)部審計工作；承擔局屬單位中央、省級和市級水利資金的監(jiān)督管理工作。

（三）水利工程股（河庫股）。負責全區(qū)水利工程建設的行業(yè)管理；指導水利工程蓄水安全鑒定和驗收；負責小型水利工程項目申報、立項、批復招標及驗收；指導全區(qū)河流干堤、重要病險水庫的除險加固；指導全區(qū)重要河流、湖泊、水庫、灘涂的開發(fā)、治理和保護；組織編制水利發(fā)展規(guī)劃及年度計劃工作。

（四）農(nóng)村供水管理辦公室。負責對全區(qū)農(nóng)村飲水現(xiàn)狀進行調研論證，做好全區(qū)農(nóng)村供水工程項目的規(guī)劃、設計；負責農(nóng)村供水工程建設管理、竣工驗收；負責制定有關農(nóng)村供水方面的制度和管理辦法，對農(nóng)村供水運行、水質安全、工程維護等進行監(jiān)督管理，做好節(jié)約用水的宣傳教育工作。

（五）水政法規(guī)股(水旱災害防御股）。指導水利行政許可工作并監(jiān)督檢查；指導水利普法工作；起草水利方面的地方性法規(guī)和政府規(guī)章草案；承辦局行政應訴、行政復議和行政賠償?shù)裙ぷ?；組織指導水政監(jiān)察和水行政執(zhí)法，協(xié)調跨流域、跨區(qū)域的水事糾紛，組織查處重大涉水違法事件。負責全區(qū)水情旱情監(jiān)測預警工作；組織編制洪水干旱防治規(guī)劃和防護標準、重要河流和重要水工程的防御旱災調度以及應急水量調度方案并組織實施；組織協(xié)調指導蓄滯洪區(qū)安全建設、管理和運用補償工作。承擔防洪保護區(qū)的洪水影響評價工作。

（六）水保移民開發(fā)股。負責全區(qū)水土流失綜合防治、監(jiān)督管理和監(jiān)測評價；組織編制全區(qū)水土保持規(guī)劃并監(jiān)督實施；組織全區(qū)水土流失調查、動態(tài)監(jiān)測、預報并公示；指導水土保持重點工程實施；承擔全區(qū)能源開采水保補償費征稽管理工作。負責全區(qū)水利工程移民規(guī)劃、計劃、審批工作；負責和指導移民安置及驗收工作；負責后期扶持的指導和監(jiān)督管理工作。

區(qū)水務局下屬9個事業(yè)單位為渭南市臨渭區(qū)水土保持和移民工作中心、渭南市臨渭區(qū)渭北飲改水工程管理處、渭南市臨渭區(qū)渭北排灌工程管理處、渭南市臨渭區(qū)水資源工作中心、渭南市臨渭區(qū)水政監(jiān)察大隊、渭南市臨渭區(qū)水利工程質量安全監(jiān)督站、渭南市臨渭區(qū)河道管理站、渭南市臨渭區(qū)水利物資管理站、渭南市臨渭區(qū)箭峪水庫灌溉管理處。