根據(jù)工作職責，區(qū)交通運輸局設4個內(nèi)設機構，現(xiàn)有3個下屬事業(yè)單位。

（一）黨政辦公室。負責局機關工作的組織協(xié)調(diào)和對外聯(lián)絡，負責督辦工作。負責交通工作綜合調(diào)研、重要報告和綜合性文件起草工作。負責文書處理、檔案管理工作。負責有關會議和活動的組織。負責黨務、黨風廉政和精神文明建設工作。負責保密管理工作。負責創(chuàng)建和宣傳報道工作。負責編制部門年度預算。負責管理預算資金和建設資金。負責系統(tǒng)資產(chǎn)的管理。負責檢查監(jiān)督系統(tǒng)財務工作。

（二）公路工程股（交通戰(zhàn)備辦公室）。負責制定轄區(qū)公路發(fā)展規(guī)劃和計劃安排。負責公路建設計劃的督促檢查和落實工作。負責公路養(yǎng)護管理和路政管理工作。負責通村公路的計劃、建設、監(jiān)督和管理工作。負責工程招投標工作。負責工程建設施工的管理工作。負責工程竣工結算驗收和工程資料歸檔管理工作。負責制定國防交通建設計劃、保障計劃、物資儲備計劃及交通保障隊伍的組訓計劃，組織完成保障任務。

（三）綜合執(zhí)法股（治超辦）。負責運輸市場管理工作。負責維修企業(yè)的行業(yè)管理工作。負責交通企業(yè)及運輸企業(yè)的行業(yè)管理。負責農(nóng)村客運站、場等建設工作。負責行政執(zhí)法工作。負責治超工作。負責交通運輸行政審批監(jiān)管協(xié)調(diào)工作，加強與區(qū)級行政審批服務部門的協(xié)調(diào)溝通。

（四）安全監(jiān)督股。負責系統(tǒng)安全生產(chǎn)、消防安全工作，組織開展安全監(jiān)督檢查。

區(qū)交通運輸局下屬3個事業(yè)單位分別為渭南市臨渭區(qū)農(nóng)村公路管理站、渭南市臨渭區(qū)交通運輸服務中心，渭南市臨渭區(qū)交通運輸綜合執(zhí)法大隊。